Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cbx1P83917 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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