Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tuba4aP68368 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tuba4aP68368 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tuba4aP68368 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tuba4aP68368 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Tuba4aP68368 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tuba4aP68368 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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