Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Spdye4b-201ENSMUST00000031574 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Disp2-203ENSMUST00000110843 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Stambp-201ENSMUST00000068054 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cpa4-201ENSMUST00000049251 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pitpnm2os1-201ENSMUST00000161697 1618 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm32023-201ENSMUST00000220168 661 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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