Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms