Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn18P56857 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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