Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms