Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms