Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms