Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms