Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nek2O35942 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms