Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20834J3QM72 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms