Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms