Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms