Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc8E9PWG2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc8E9PWG2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms