Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms