Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl8Q9Z121 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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