Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tubgcp4Q9D4F8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms