Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms