Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms