Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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