Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmed9Q99KF1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms