Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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