Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms