Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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