Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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