Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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