Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Samd12Q0VE29 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms