Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Kcnma1Q08460 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Kcnma1Q08460 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnma1Q08460 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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