Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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