Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SgcaP82350 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SgcaP82350 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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