Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms