Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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