Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SbdsP70122 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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