Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab8bP61028 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms