Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms