Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Xrcc5P27641 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc5P27641 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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