Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl1P12850 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl1P12850 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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