Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tnp1P10856 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms