Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
TtrP07309 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
TtrP07309 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TtrP07309 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TtrP07309 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms