Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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