Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MttpO08601 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
MttpO08601 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms