Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms