Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ckap5A2AGT5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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