Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms