Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3Q9Z2D8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms