Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms