Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms