Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pin4Q9CWW6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms