Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nek8Q91ZR4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms