Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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